环境监测站也会产生废水，为什么呢？主要有两个方面：一个是化验室自身产生的废水，二是所需监测的废水。由于监测站的条件有限，许多监测站的废水都是不经处理直接排入了城市下水管道, 形成二次污染。
环境监测站化验室的废水根据其特点可分为两大类, 一类是无机废水, 一类是有机废水。
一.无机废水的处理：
1.六价铬：六价铬废水一般存在于皮革揉制、电镀、铬黄染料废水及冷却水(阻蚀剂)中, 是一种致癌物质, 环境监测站化验室的含六价铬废水水量小、铬浓度低( < 20mg /l) , 在这种情况下, 可先将六价铬还原为, 三价铬后再用碱(氢氧化钠)进行沉淀, 如选用硫酸亚铁作还原剂, 废水PH 控制在8-9范围, 选用亚硫酸钠作还原剂, 废水pH 控制在2-3范围, 其他还原剂还有二氧化硫、亚硫酸氢钠、连二亚硫酸钠等, 化验员可根据情况选用。
2.铅：铅是工业上使用最广泛的有色金属之一, 常作为一种工业原料应用于蓄电池的极板、颜料、香橡胶、农药、涂料等制造业。废水中可溶性铅一般先使之形成铅沉淀物, 再去除, 所使用的沉淀剂有石灰、苛性碱、苏打及磷酸盐等, 如使用石灰, PH控制在7. 5- 9. 0范围; 使用苛性碱PH 控制在10以上。
3.镉：镉的应用于电镀、颜料、合金及电池等,主要处理的方法有有沉淀法, 吸附法。使用沉淀法, 沉淀剂有氢氧化物、硫化物、聚合硫酸铁,使用氢氧化物。
4.汞：汞广泛应用在氯碱、制浆造纸、农药、电子、仪表等行业中, 对于汞的去处, 经典方法是硫化物沉淀法, pH控制在中性范围, 化验员在使用此方法时要注意不要使硫化物过量, 避免残余硫产生的污染问题。
5.砷：无机砷主要以亚砷酸离子和砷酸离子的形式存在于水中, 存在于冶金、皮革加工、硫酸、染料、农药生产中。砷的常规处理方法包括石灰或硫化物沉淀, 或者用铁或铝的氢氧化物沉淀, 再加上混凝剂絮凝吸附。使用石灰, pH 控制在11. 5以上, 使用硫化物pH控制在7左右。
6.氰化物：氰化物是剧毒物质, 主要存在于电镀、煤气厂、染料厂等废水中, 对于此类废水, 化验员可直接投加次氯酸钠, 搅拌即可。
二.有机废水处理
酚：随着石油化工、塑料、合成纤维、焦化等工业的迅速发展, 各种含酚废水也相应增多, 酚的毒性较高, 使用活性炭作吸附剂是一种可行的方法。对于其他有毒有害有机废水, 化验员也可用此方法。
环境监测站如果不能对废水好好处理就会造成污染，对这些有毒有害的有机、无机废水, 以上方法均为操作简单, 实用的方法, 化验员需要注意的是对于沉淀物的处理, 不能随便丢弃,应集中收集后, 送有毒有害废弃物处理中心进一步处理。
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